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新疆生产建设兵团第一师医院 新疆维吾尔自治区阿克苏地区
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哈密市中心医院 新疆维吾尔自治区哈密市
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新疆生产建设兵团医院 新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市
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04伊犁州新华医院 新疆维吾尔自治区伊犁哈萨克自治州
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05昌吉市人民医院 新疆维吾尔自治区昌吉回族自治州
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06喀什地区第一人民医院 新疆维吾尔自治区喀什地区
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07库尔勒市第一人民医院 新疆维吾尔自治区巴音郭楞蒙古自治州
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08鲁中冶金矿业集团职工医院 新疆维吾尔自治区乌鲁木齐市
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09焉耆县人民医院 新疆维吾尔自治区巴音郭楞蒙古自治州
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10武警8660部队医院 新疆维吾尔自治区伊犁哈萨克自治州
排名依据
医院排名依次参考如下资料：
(1) 复旦大学医院管理研究所《中国医院及专科声誉排行榜》
(2) 政府卫生部门评定的临床重点专科和教育部门评定的重点学科分布
(3) 医院对应科室的高级职称人数
(4) 医院对应科室的床位数