普通外科是北大医院历史最悠久的科室之一，在建院之初就同时建立，时至今日已有九十余年的历史。古老而又年轻的普通外科，如同一棵百年古树，她既有发达的根系，壮硕的躯干，又有繁茂的枝叶。不仅培育了一代又一代的外科英才，而且更主要的是，惠及了无数的患者。她的枝叶早已超出了北大医院，延展至从内陆到沿海，从首都北京到边塞寒江的祖国的不同角落，乃至世界各地。回首自建科至今的历程，我们看到一个充满活力的普通外科正在稳步走来。
　　北大医院普通外科拥有开放床位146张，在职博士生导师4名，在职教授5名，正主任医师15名，副主任医师20名，主治医师10名。
　　普通外科随着学科专业化道路的不断深入，基本形成专病专科，专家专科。外一为肝胆、胰腺专业病房；外二为肝胆专业病房和腹腔镜外科；外三为胃肠专业病房；外四为乳腺疾病中心。同时拥有全国领先的纤维电子胃、肠镜，内镜超声中心，胆道镜、ERCP中心，年度行息肉切除、曲张静脉套扎、胆道镜Oddis括约肌切开取 石、胆道镜取石以及支架置入等内镜治疗1200余例，成功率居全国之首。
　　普通外科以开展各种高难度的复杂外科手术为特点，全年完成手术例数3000余例，胃癌根治切除150例、结肠癌180例、直肠癌170例，胰头癌根治术50例，胆管癌根治术30例。胃肠肿瘤的外科手术治疗方面切除率高、根治范围彻底、生存率高，尤其对局部晚期直肠癌及直肠癌术后复发的治疗，在国内居领先地位；胰腺专业在胰腺癌、慢性胰腺炎的治疗中积累了丰富的经验，年均胰十二指肠切除手术50例以上，胰腺癌的手术切除率达70％以上，包括血管切除重建、区域扩大切除手术，围手术期死亡率3%以下，生存率明显提高，居国内领先；肝胆专业在国内率先开展肝门胆管癌手术，可行联合右半肝、尾叶切除、左叶切除在内的肝门胆管癌手术，在病例数量、切除率及疗效等方面与世界水平同步；乳腺疾病中心以普外四病房为核心，每年治疗新发乳癌患者300余例，强调多学科综合治疗，规范检查、治疗方案，保乳手术率国内领先。