儿童外科分两个病区，目前主要设有新生儿外科（外1病区）、胸外科（外1病区）、普外科（外2病区）、泌尿外科、（外2病区）共4个亚专科。
　　目前开放床位数共91张，其中普外科23张，泌尿外科20张，新生儿外科28张，胸外科20张。现外科医师人员共20人，硕士4人，其余为本科及以上学历。其中主任医师2人，副主任医师8人。
　　主要采用保守或开放手术、腹腔镜技术等技术和方法诊治包括：先天性直肠肛门闭锁或狭窄、先天性十二指肠闭锁或狭窄、先天性空肠闭锁或狭窄、先天性回肠闭锁或狭窄、先天性小肠闭锁或狭窄、先天性结肠闭锁或狭窄、先天性食管闭锁或狭窄、先天性食道裂孔疝、先天性膈疝、先天性膈膨升、脓胸、气胸、纵膈气肿、先天性腺瘤样肺囊肿、先天性脐膨出、尿道下裂、肾创伤、尿道断裂、创伤后尿道断裂、肾恶性肿瘤、肾交界性肿瘤、肾良性肿瘤、先天性巨结肠、先天性胆总管囊肿、先天性胆道闭锁、新生儿胃肠道穿孔、先天性肠旋转不良、先天性肥大性幽门狭窄、先天性肾积水、先天性肾盂输尿管狭窄、先天性膀胱肿瘤、儿童睾丸肿瘤、瘢痕性肛门狭窄、颈部淋巴管瘤等。